PoLyInfo Ontology Version 1.0

This 'PoLyInfo Ontology' summarizes the concept classes, predicates, instances, etc. necessary for machine-readable representation of the polymer knowledge in PoLyInfo. It is an essential concept system for semantic search of PoLyInfoRDF, which is published in an authentication endpoint. In other words, by using these definitions, rules of thumb and new discoveries also become polymer knowledge shareable with PoLyInfo. On the other hand, the PoLyInfo ontology is consistent with the internationally known upper ontology BFO. This means that it can be linked to many other disciplines that are conforming to BFO, and PoLyInfo is now part of a huge body of knowledge that goes beyond polymer chemistry to address major societal issues such as environmental problems. Based on these considerations, possible uses of the PoLyInfo ontology include the following.
・ Machine-readable understanding of the polymer knowledge contained in PoLyInfoRDF and its use for semantic search (for use inside PoLyInfo)
・ Designing linkage methods for cross-search between your dataset and PoLyInfoRDF (for use inside Polymer Chemistry, including PoLyInfo).
・ Design of ontology linking external databases and PoLyInfoRDF (for use outside of Polymer Chemistry)

Information for Data Use
Namespace
 http://dice.nims.go.jp/ontology/PoLyInfo-ont/Schema#
SPARQL endpoint
 https://materials-open-rdf.nims.go.jp/sparql
Public ontology viewer
 https://materiage.org/pli/

The PoLyInfo ontology will be detailed in a forthcoming paper. The bibliographic information of the papers will be published on this site and the papers will also be registered in the MDR.
The license for use of this ontology is CC BY. Please include the author and DOI of the version you are citing: (Example Sentence)
'This data structure conforms to the PoLyInfo ontology Version 1.0 [1].
[1] Masashi Ishii and Koichi Sakamoto, PoLyInfo Ontology Version 1.0,  https://doi.org/10.48505/nims.4414 (2024)'
If you wish to cite the ontology and conceptual schema together, the latest version or in general, please refer to the citation instructions provided at collection site ( https://doi.org/10.48505/nims.4413).

Abbreviation List
BFO: Basic Formal Ontology
RDF: Resource Description Framework
SPARQL: SPARQL Protocol And RDF Query Language


本「PoLyInfo オントロジー」は、PoLyInfoの高分子知識を機械可読に表現する上で必要な概念クラス、述語、インスタンス等をまとめたものです。別途認証エンドポイント公開しているPoLyInfoRDFのセマンティックな検索を実現する上で、必須の概念体系となります。言い換えると、これらの定義を使うことで、経験則や新しい発見もPoLyInfoと高分子知識を共有できることになります。一方で、PoLyInfo オントロジーは、国際的に知られた上位オントロジーBFOと整合しています。すなわちBFOに準拠する多くの分野と連携が可能になっており、今やPoLyInfoは高分子化学を越えて、環境問題など大きな社会課題に取り組むための巨大知識の一部を担っています。これらのことから、PoLyInfo オントロジーの使い方として、以下のことが考えられます。
・ PoLyInfoRDFに含まれる高分子知識の機械可読な理解と、セマンティックな検索への利用（PoLyInfo内での利用）
・ ご自身がお持ちのデータセットとPoLyInfoRDFの横断検索のためのリンク方法の設計（PoLyInfoを含む高分子化学内での利用）
・ 外部データベースとPoLyInfoRDFの連携オントロジーの設計（高分子化学外での利用）

データ利用の情報
名前空間
 http://dice.nims.go.jp/ontology/PoLyInfo-ont/Schema#
SPARQLエンドポイント
 https://materials-open-rdf.nims.go.jp/sparql
Ontology ビューアー
 https://materiage.org/pli/

PoLyInfo オントロジーの内容は、近刊の論文の中で詳述します。論文書誌情報はこのサイトで公開し、また論文もMDRに登録予定です。
本オントロジーの利用ライセンスはCC BYです。引用するバージョンの著者とDOIの記載をお願いします：
（文例）
「本データ構造はPoLyInfo オントロジー[1]に準拠した。
[1] Masashi Ishii and Koichi Sakamoto, PoLyInfo オントロジー,  https://doi.org/10.48505/nims.4414 (2024)」
オントロジーと概念スキーマを一緒に引用する場合、最新版や一般的に引用する場合は、コレクションサイトに記載の引用方法をご参照ください( https://doi.org/10.48505/nims.4413)。

略語一覧：
BFO: Basic Formal Ontology
RDF: Resource Description Framework
SPARQL: SPARQL Protocol And RDF Query Language