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[JOSS2023_DataCiteを選んだ理由.pdf](https://mdr.nims.go.jp/filesets/f90788f2-8297-4ec7-ad79-bd8996f888dd/download)

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[田辺浩介](https://orcid.org/0000-0002-9986-7223)

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[Creative Commons BY Attribution 4.0 International](https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

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[DataCiteを選んだ理由 ～Materials Data RepositoryにおけるDataCite DOIの活用～](https://mdr.nims.go.jp/datasets/246664ce-0ad5-44ee-b51c-83fc74ba7313)

## Fulltext

NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMDataCiteを選んだ理由Materials Data RepositoryにおけるDataCite DOIの活用田辺浩介 TANABE.Kosuke@nims.go.jp物質・材料研究機構技術開発・共用部門 材料データプラットフォーム データ基盤ユニット 主幹エンジニアhttps://orcid.org/0000-0002-9986-72232023年6月22日 JAPAN OPEN SCIENCE SUMMIT 2023 セッションD3mailto:TANABE.Kosuke@nims.go.jphttps://orcid.org/0000-0002-9986-7223NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM1. Materials Data Repository (MDR)とはNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM3Materials Data Repository (MDR)•物質・材料研究機構(NIMS)が開発・運用するデータリポジトリ◦ https://mdr.nims.go.jp• NIMSの研究成果である論文ファイルや、材料科学に関するデータ（実験・計測データ）を収録• 2020年6月15日より運用開始• 2023年6月20時点で、約1500件のPublication（出版物）と約12,700件のDataset（研究データ）を収録• NIMSの研究者総覧データベース「SAMURAI」とも連携して動作◦ https://samurai.nims.go.jphttps://mdr.nims.go.jp/https://samurai.nims.go.jp/NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM4Materials Data Repository (MDR)https://mdr.nims.go.jphttps://mdr.nims.go.jp/NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM5MDRに収録するデータ•大きく分けてDatasetとPublicationの2種類を扱う• Dataset: 材料データ◦ 実験で使用した数値や画像のデータなどを想定◦ 材料関係のメタデータを記述可能• Publication: 論文のデータ◦ 論文ファイル（の著者版）を登録することを想定◦ 一般的な機関リポジトリと同様の運用MDR XAFS DB国内6組織によるX線吸収微細構造の計測データ集https://doi.org/10.48505/nims.1447https://doi.org/10.48505/nims.14477https://mdr.nims.go.jp/concern/datasets/vh53wz94c?locale=enhttps://mdr.nims.go.jp/concern/datasets/vh53wz94c?locale=en8実験・計測データのメタデータ装置・試料の情報が記録されているhttps://doi.org/10.48505/nims.4192https://doi.org/10.48505/nims.4192MDRで付与したDataCite DOI論文の著者最終稿ファイル論文の付随データファイルhttps://doi.org/10.48505/nims.1440https://doi.org/10.48505/nims.1440NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM12MDRでのDataCite DOIの付与• MDRに登録する論文・データに対して、DataCite DOIを付与• 2023年6月20日時点で、2872件のDataCite DOIを付与している◦ 日本の研究機関別付与数では、JAMSTEC（3659件）の次に多い◦ JAXA1059件、DIAS153件、極地研147件、九大115件、環境研64件、京大4件• DOIの付与対象は研究データ全般と論文著者版◦ Gold OAになっている論文も収録しているが、MDRではDOIは付与しない◦ その他、すでに他の場所でDOIが付与されているデータには付与しない• NIMSはJaLC経由ではなく、DataCiteの会員になってDataCite DOIを付与している◦ JaLC経由でDataCite DOIを付与する場合、本来DataCiteがサポートしているメタデータ項目や機能が使用できないことがある（後述）NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM13MDRでのDataCite DOIの文献種別ごとの付与状況resourceType（文献種別） 付与数Dataset 2677Journal Article 141Text 16Other 14Collection 10Software 5Preprint 4Conference Paper 2Book Chapter 1Book 1Conference Proceeding 1Report 1NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM2. なぜDataCite DOIを付与しているのかNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM15MDRでDataCite DOIを付与している理由•研究データのDOIとして広く用いられているから•外部データベースへの収録に優位性があるから◦ OpenAIRE Explore, Data Citation Index, Mendeley Data, Dimensions, Ex Libris Central Discovery Indexhttps://support.datacite.org/docs/where-can-i-search-doi-metadata•豊富で使いやすいAPIを備えているから◦ NIMSはJAIRO Cloudを使用していないため、DOIの付与の方法を別途用意する必要があった•研究データだけでなく、文献に対するDOIも付与できるから◦ 論文（著者版）にもDOIを付与したいという要望があった◦ figshareやZenodo, arXivで付与されているDOIはDataCite DOINATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM• Audiovisual• Book• BookChapter• Collection• ComputationalNotebook• ConferencePaper• ConferenceProceeding• DataPaper• Dataset• Dissertation• Event• Image• InteractiveResource• Journal• JournalArticle• Model• OutputManagementPlan• PeerReview16• PhysicalObject• Preprint• Report• Service• Software• Sound• Standard• Text• Workflow• Other• （ただし現在のJaLCでは、文献に対するDataCite DOIの付与をサポートしていない）論文や書籍に加えて、DMPやプレプリント、ソースコードや査読歴など、新しい種別の研究情報にも対応しているDataCiteのresourceType（資料種別、2023年6月時点）NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM17DataCite API• REST・OAI-PMH・GraphQLの各インターフェースが用意されており、いろいろなアプリケーションににかんたんに組み込める• JaLC APIと異なり、JSONでDOI登録用のメタデータが書ける◦ 以下のようなJSONをPOSTで送信するだけで、DOIが付与できる◦ 実際にはリゾルブ先のURLやタイトル・著者名などが必要• （ただし現在のJaLCでは、DataCite APIによるDOIの付与をサポートしていない）https://support.datacite.org/docs/api-create-doishttps://support.datacite.org/docs/api-create-doisNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM18DOI付与のためのメタデータ• DataCite DOIが研究データ用のメタデータだからといって、個別の研究分野の詳細なメタデータが記述できるわけではない◦ 地理情報（緯度・経度）や「データ収集日」といった項目はある◦ むしろ文献以外にもDOIが付与できるよう、メタデータの記述が簡略化されているとも言える◦ MDRでは、材料科学のメタデータは別途CSV・JSON・YAMLファイルで記述• DataCite Schema 4.4で、文献のメタデータの項目が大幅に増加した◦ DataCite Schema 4.3までは、文献のメタデータを記述するための項目が少なく、ジャーナル名など論文のメタデータを記述するのに苦労したNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMDataCite DOI付与用のメタデータ（抜粋）19タイトルやデータ作成者名など。研究データそのもののメタデータはほとんど含まれないNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMMDRでの材料メタデータの記述例20MDR独自のメタデータ。現在のDataCiteでは、これらの研究分野個別のメタデータは扱えないので、 CSVやJSON、YAMLなどで別途メタデータを記述する必要があるNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM3. MDRでのDataCite DOIのワークフローNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM221. 研究データファイルの登録研究者•研究者は「MDR登録システム」（データ登録用の内部アプリケーション）にログインし、MDRに登録するファイルをアップロードする•関連URLに論文DOIを入力すると、著者名やタイトルが自動入力される◦ NIMSの研究者総覧「SAMURAI」などの所内データベースから取得•研究者がデータを登録すると、MDR担当者に通知が届くMDR運用担当者MDR登録システム書誌情報を自動入力ファイル登録 登録通知NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMMDR登録システム23タイトルや著者名は、NIMS内のデータベースから自動的に取得して入力されるNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM242. 研究データの公開準備作業とDataCite DOIの付与• MDR担当者は登録された書誌事項とファイルをチェックし、公開可否、ならびにDataCite DOIの登録可否を判断する• DataCite DOIの登録が行える場合、MDR登録画面からDataCite DOIを予約する◦ MDR登録システムがDataCite APIを呼び出す◦ 論文付随データの場合、論文DOIとデータDOIの関連も自動的に作成される◦ 必要に応じて、予約したDOIを研究者に連絡し、執筆中の論文にデータのDOIを記入できるようにするMDR登録システムMDR運用担当者DOIをDraftで作成DOI予約API呼び出しNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM253. 研究データの公開• MDR担当者は公開を承認し、DataCite DOIを有効化する• 公開が承認されたデータは、自動的にMDRに送付されて公開される。あわせて、SAMURAIにもMDRへのリンクが自動的に追加されるMDR登録システムMDR運用担当者公開承認DOI有効化公開MDRへのリンク追加NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMNIMSの研究者総覧SAMURAIとのリンク26SAMURAIの論文詳細ページに、MDRに登録した論文付随データのリンクが追加されるNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM274. 研究データの流通• DataCite DOIはMDRのURLにリゾルブされる• DataCiteに収録された研究データのメタデータは、DataCite APIを通して、DataCite自身の検索サービスや外部検索データベースに収録され、研究者が検索できるようになるData Citation Index研究者リゾルブデータ収集データ収集NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM外部データベースへのデータ提供28MDRでDataCite DOIが付与されたデータセットは、Clarivate社のData Citation Indexに収録されるNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM4. MDRでのDataCite DOIの今後の活用予定NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMDOIの付与対象の拡大•実験装置・試料へのDOI付与◦ 研究データの検索や追跡のために、「どの実験でどの試料を用いたか」「どの実験でどの装置を用いたか」といった情報を管理する必要が生まれてきている◦ 現在策定中のDataCite Schema 4.5で、resourceTypeにInstrumentが追加◦ 実験装置のPID付与については、RDAのPersistent Identification of Instruments WGで議論◦ RDUFの「研究資料・実験機器へのPID付与検討小委員会」で、ホワイトペーパーの和訳を作成https://pindinst-white-paper.readthedocs.io/ja/latest/◦ DataCiteでは試料に対するIDとして、IGSN(International GenericSample Number)をサポートしているhttps://pindinst-white-paper.readthedocs.io/ja/latest/NATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM31研究データの利用統計•データ共有・公開を促すためにも、MDRで提供しているデータの利用状況を研究者に示すことは極めて重要• DataCiteはCOUNTER準拠のデータの利用統計を提供しており、MDRでもこれを採用したい•以前は集計用のログを自前で収集しなければならなかったが、2023年にDataCiteがJavaScriptによるトラッカーのβ版をリリース◦ Google Analyticsのように、HTMLにタグを埋め込むだけで利用統計が取れる◦ https://support.datacite.org/docs/datacite-usage-tracker•ダウンロード数や引用数の表示も、HTMLにタグを埋め込むことで可能◦ 以下が表示例https://support.datacite.org/docs/displaying-usage-and-citations-in-your-repositoryhttps://support.datacite.org/docs/datacite-usage-trackerhttps://support.datacite.org/docs/displaying-usage-and-citations-in-your-repository32松本崇博. 試料PID付与に関する動向. 第25回XAFS討論会 XAFSデータベース セッション. 2022https://www.jxafs.org/w/wp-content/uploads/2022/08/2022_Aug_3_Sample_PID_Matsumoto.pdfDOIから材料科学分野の個別メタデータにつないでいくhttps://www.jxafs.org/w/wp-content/uploads/2022/08/2022_Aug_3_Sample_PID_Matsumoto.pdfNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORM33まとめ• PIDは、複雑なデータの結びつきを解きほぐすための鍵•研究活動も、それに付随するデータ管理も、ほんとうに多様化している•論文だけでなく、研究データや実験装置など、さまざまなものにPIDが付与されるようになっている•DOI、ならびにDOIと連携して動作する他のPIDを通して、複雑で多様化する研究活動が、研究者にもデータ管理者にももっとFAIRなものになるはずNATIONAL INSTITUTE FOR MATERIALS SCIENCE   |    MATERIALS DATA PLATFORMTANABE.Kosuke@nims.go.jp スライド 1: DataCiteを選んだ理由 Materials Data RepositoryにおけるDataCite DOIの活用 スライド 2: 1. Materials Data Repository (MDR)とは スライド 3: Materials Data Repository (MDR) スライド 4: Materials Data Repository (MDR) スライド 5: MDRに収録するデータ スライド 6 スライド 7 スライド 8 スライド 9 スライド 10 スライド 11 スライド 12: MDRでのDataCite DOIの付与 スライド 13: MDRでのDataCite DOIの文献種別ごとの付与状況 スライド 14: 2. なぜDataCite DOIを付与しているのか スライド 15: MDRでDataCite DOIを付与している理由 スライド 16: DataCiteのresourceType（資料種別、2023年6月時点） スライド 17: DataCite API スライド 18: DOI付与のためのメタデータ スライド 19: DataCite DOI付与用のメタデータ（抜粋） スライド 20: MDRでの材料メタデータの記述例 スライド 21: 3. MDRでのDataCite DOIのワークフロー スライド 22: 1. 研究データファイルの登録 スライド 23: MDR登録システム スライド 24: 2. 研究データの公開準備作業とDataCite DOIの付与 スライド 25: 3. 研究データの公開 スライド 26: NIMSの研究者総覧SAMURAIとのリンク スライド 27: 4. 研究データの流通 スライド 28: 外部データベースへのデータ提供 スライド 29: 4. MDRでのDataCite DOIの今後の活用予定 スライド 30: DOIの付与対象の拡大 スライド 31: 研究データの利用統計 スライド 32 スライド 33: まとめ スライド 34: TANABE.Kosuke@nims.go.jp